Film, yeni açılan Periler Okulu’ndaki macerayı konu ediniyor. Dünya bütün perilerin varlığından haberdar olmuştur. Yaşanan karışıklıklar yüzünden Periliçe sihir yaparak fanilerin hafızasını siler. Küçük perilerin eğitimi de artık Dünya’da değil, Periler alemindeki Periler Okulu’nda verilecektir. Dudu, Betüş, Perihan ve Pakize okulda görev alırlar. Fakat onları, okulda bekleyen başka sihirli güçler de vardır.